Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbxo41Q6NS60 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Fbxo41Q6NS60 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbxo41Q6NS60 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbxo41Q6NS60 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbxo41Q6NS60 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbxo41Q6NS60 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbxo41Q6NS60 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbxo41Q6NS60 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbxo41Q6NS60 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbxo41Q6NS60 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbxo41Q6NS60 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbxo41Q6NS60 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbxo41Q6NS60 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbxo41Q6NS60 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbxo41Q6NS60 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbxo41Q6NS60 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbxo41Q6NS60 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbxo41Q6NS60 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fbxo41Q6NS60 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Fbxo41Q6NS60 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Fbxo41Q6NS60 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Fbxo41Q6NS60 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fbxo41Q6NS60 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fbxo41Q6NS60 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fbxo41Q6NS60 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fbxo41Q6NS60 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fbxo41Q6NS60 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fbxo41Q6NS60 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fbxo41Q6NS60 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fbxo41Q6NS60 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms