Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms