Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf8Q6DID3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms