Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFY8

Brinp2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp2Q6DFY8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brinp2Q6DFY8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brinp2Q6DFY8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brinp2Q6DFY8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brinp2Q6DFY8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Brinp2Q6DFY8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms