Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF3

Gba2, Non-lysosomal glucosylceramidase, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gba2Q69ZF3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gba2Q69ZF3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms