Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf260Q62513 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms