Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Supt6hQ62383 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Supt6hQ62383 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Supt6hQ62383 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Supt6hQ62383 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Supt6hQ62383 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Supt6hQ62383 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Supt6hQ62383 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Supt6hQ62383 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.1 ms