Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Ttf1Q62187 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Ttf1Q62187 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Ttf1Q62187 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Ttf1Q62187 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Ttf1Q62187 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Ttf1Q62187 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Ttf1Q62187 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Ttf1Q62187 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Ttf1Q62187 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Ttf1Q62187 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Ttf1Q62187 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttf1Q62187 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Ttf1Q62187 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf1Q62187 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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