Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sin3bQ62141 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms