Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd47Q61735 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd47Q61735 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms