Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

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Length 441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Pacsin1Q61644 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
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Pacsin1Q61644 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Pacsin1Q61644 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Pacsin1Q61644 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Pacsin1Q61644 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Pacsin1Q61644 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Pacsin1Q61644 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Pacsin1Q61644 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Pacsin1Q61644 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacsin1Q61644 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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