Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Irf9Q61179 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Irf9Q61179 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms