Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

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Length 930 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpc6Q61143 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpc6Q61143 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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Trpc6Q61143 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpc6Q61143 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpc6Q61143 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpc6Q61143 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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Trpc6Q61143 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpc6Q61143 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpc6Q61143 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpc6Q61143 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpc6Q61143 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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Trpc6Q61143 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpc6Q61143 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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Trpc6Q61143 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc6Q61143 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc6Q61143 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc6Q61143 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc6Q61143 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Trpc6Q61143 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc6Q61143 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc6Q61143 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc6Q61143 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc6Q61143 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc6Q61143 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Trpc6Q61143 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trpc6Q61143 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpc6Q61143 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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Trpc6Q61143 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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Trpc6Q61143 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpc6Q61143 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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Trpc6Q61143 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc6Q61143 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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Trpc6Q61143 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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Trpc6Q61143 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc6Q61143 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc6Q61143 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc6Q61143 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc6Q61143 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trpc6Q61143 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
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Trpc6Q61143 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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Trpc6Q61143 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc6Q61143 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc6Q61143 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc6Q61143 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc6Q61143 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc6Q61143 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc6Q61143 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc6Q61143 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc6Q61143 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc6Q61143 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc6Q61143 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc6Q61143 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc6Q61143 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc6Q61143 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc6Q61143 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc6Q61143 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc6Q61143 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc6Q61143 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc6Q61143 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc6Q61143 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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