Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
JrkQ60976 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JrkQ60976 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
JrkQ60976 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JrkQ60976 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
JrkQ60976 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
JrkQ60976 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
JrkQ60976 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
JrkQ60976 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
JrkQ60976 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
JrkQ60976 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms