Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbpQ60925 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbpQ60925 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbpQ60925 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbpQ60925 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbpQ60925 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DbpQ60925 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbpQ60925 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbpQ60925 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbpQ60925 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbpQ60925 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbpQ60925 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbpQ60925 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms