Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HellsQ60848 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HellsQ60848 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HellsQ60848 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HellsQ60848 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HellsQ60848 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HellsQ60848 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HellsQ60848 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HellsQ60848 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HellsQ60848 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms