Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkn2dQ60773 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn2dQ60773 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms