Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcf4Q60722 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcf4Q60722 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcf4Q60722 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcf4Q60722 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcf4Q60722 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcf4Q60722 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcf4Q60722 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcf4Q60722 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcf4Q60722 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcf4Q60722 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcf4Q60722 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcf4Q60722 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcf4Q60722 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcf4Q60722 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcf4Q60722 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcf4Q60722 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcf4Q60722 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcf4Q60722 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcf4Q60722 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcf4Q60722 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcf4Q60722 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcf4Q60722 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcf4Q60722 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcf4Q60722 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcf4Q60722 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tcf4Q60722 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms