Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samhd1Q60710 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samhd1Q60710 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samhd1Q60710 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms