Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp20Q5XG71 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp20Q5XG71 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms