Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Scaf1Q5U4C3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scaf1Q5U4C3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms