Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NotoQ5TIS6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms