Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myh1Q5SX40 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms