Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRX1

Tom1l2, TOM1-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l2Q5SRX1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1l2Q5SRX1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1l2Q5SRX1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1l2Q5SRX1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1l2Q5SRX1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1l2Q5SRX1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1l2Q5SRX1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1l2Q5SRX1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1l2Q5SRX1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1l2Q5SRX1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1l2Q5SRX1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1l2Q5SRX1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Tom1l2Q5SRX1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tom1l2Q5SRX1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tom1l2Q5SRX1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tom1l2Q5SRX1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms