Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm6bQ5NCY0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm6bQ5NCY0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms