Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

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Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nlrc3Q5DU56 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrc3Q5DU56 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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