Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Znf608Q56A10 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
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Znf608Q56A10 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
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Znf608Q56A10 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Znf608Q56A10 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Znf608Q56A10 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Znf608Q56A10 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Znf608Q56A10 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Znf608Q56A10 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
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