Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc84Q4VA36 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms