Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0F0

Rimbp3, RIMS-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rimbp3Q3V0F0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rimbp3Q3V0F0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rimbp3Q3V0F0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms