Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp48Q3V0C5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp48Q3V0C5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp48Q3V0C5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
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