Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm5aQ3UXZ9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm5aQ3UXZ9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm5aQ3UXZ9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm5aQ3UXZ9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm5aQ3UXZ9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm5aQ3UXZ9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Kdm5aQ3UXZ9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Kdm5aQ3UXZ9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Kdm5aQ3UXZ9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm5aQ3UXZ9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm5aQ3UXZ9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms