Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3UJP5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3UJP5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3UJP5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3UJP5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3UJP5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3UJP5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3UJP5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3UJP5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UJP5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UJP5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3UJP5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3UJP5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3UJP5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3UJP5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3UJP5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Q3UJP5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3UJP5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3UJP5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3UJP5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3UJP5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3UJP5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3UJP5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3UJP5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3UJP5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3UJP5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3UJP5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3UJP5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3UJP5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3UJP5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3UJP5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3UJP5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3UJP5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3UJP5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3UJP5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3UJP5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3UJP5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3UJP5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3UJP5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3UJP5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3UJP5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3UJP5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3UJP5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3UJP5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3UJP5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3UJP5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms