Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rrp36Q3UFY0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrp36Q3UFY0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrp36Q3UFY0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms