Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdgfl1Q2VPR5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms