Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

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Length 807 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
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Perm1Q149B8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Perm1Q149B8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Perm1Q149B8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Perm1Q149B8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Perm1Q149B8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Perm1Q149B8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Perm1Q149B8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Perm1Q149B8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Perm1Q149B8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Perm1Q149B8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Perm1Q149B8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Perm1Q149B8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Perm1Q149B8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Perm1Q149B8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Perm1Q149B8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Perm1Q149B8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Perm1Q149B8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Perm1Q149B8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Perm1Q149B8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Perm1Q149B8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Perm1Q149B8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Perm1Q149B8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Perm1Q149B8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Perm1Q149B8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms