Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r181Q0P547 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms