Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
1700061G19RikQ08EE8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms