Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Tff1Q08423 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tff1Q08423 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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