Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrstQ06666 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrstQ06666 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrstQ06666 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrstQ06666 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrstQ06666 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrstQ06666 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrstQ06666 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrstQ06666 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrstQ06666 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms