Protein–RNA interactions for Protein: Q05BQ1

Igsf9, Protein turtle homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf9Q05BQ1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Igsf9Q05BQ1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf9Q05BQ1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms