Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PtprgQ05909 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtprgQ05909 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms