Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

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Length 2,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Nf1Q04690 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Nf1Q04690 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Nf1Q04690 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Nf1Q04690 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nf1Q04690 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Nf1Q04690 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Nf1Q04690 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Nf1Q04690 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Nf1Q04690 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Nf1Q04690 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Nf1Q04690 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nf1Q04690 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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