Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Smpd1Q04519 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smpd1Q04519 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smpd1Q04519 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smpd1Q04519 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smpd1Q04519 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smpd1Q04519 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smpd1Q04519 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smpd1Q04519 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smpd1Q04519 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smpd1Q04519 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smpd1Q04519 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smpd1Q04519 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smpd1Q04519 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smpd1Q04519 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smpd1Q04519 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smpd1Q04519 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smpd1Q04519 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smpd1Q04519 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms