Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacna1sQ02789 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms