Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htr1fQ02284 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htr1fQ02284 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms