Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Grin2cQ01098 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms