Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VegfaQ00731 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms