Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sycp3P70281 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sycp3P70281 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sycp3P70281 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sycp3P70281 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sycp3P70281 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sycp3P70281 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sycp3P70281 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Sycp3P70281 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sycp3P70281 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms