Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DccP70211 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DccP70211 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DccP70211 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DccP70211 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DccP70211 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DccP70211 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DccP70211 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DccP70211 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DccP70211 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DccP70211 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DccP70211 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DccP70211 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DccP70211 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DccP70211 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DccP70211 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DccP70211 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DccP70211 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DccP70211 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DccP70211 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DccP70211 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DccP70211 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DccP70211 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DccP70211 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DccP70211 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DccP70211 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DccP70211 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
DccP70211 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DccP70211 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DccP70211 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DccP70211 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DccP70211 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DccP70211 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DccP70211 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DccP70211 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DccP70211 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DccP70211 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DccP70211 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DccP70211 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DccP70211 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DccP70211 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DccP70211 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DccP70211 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DccP70211 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DccP70211 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DccP70211 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DccP70211 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DccP70211 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DccP70211 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DccP70211 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DccP70211 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DccP70211 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DccP70211 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DccP70211 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DccP70211 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DccP70211 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DccP70211 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DccP70211 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DccP70211 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DccP70211 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DccP70211 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DccP70211 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DccP70211 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DccP70211 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DccP70211 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DccP70211 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DccP70211 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DccP70211 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DccP70211 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DccP70211 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DccP70211 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DccP70211 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DccP70211 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DccP70211 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DccP70211 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DccP70211 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DccP70211 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DccP70211 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DccP70211 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DccP70211 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DccP70211 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DccP70211 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DccP70211 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DccP70211 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DccP70211 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DccP70211 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DccP70211 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DccP70211 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DccP70211 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DccP70211 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DccP70211 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DccP70211 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DccP70211 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DccP70211 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DccP70211 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DccP70211 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DccP70211 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DccP70211 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DccP70211 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DccP70211 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms