Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta1P68134 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta1P68134 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta1P68134 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms